Folding @ Home est un excellent moyen pour les techniciens d’aider à la recherche sur le coronavirus (COVID-19)

Pour ceux d’entre vous coincés à la maison pendant l’épidémie de COVID-19, la situation peut sembler un peu désespérée, car vous êtes relégué à vous asseoir et à attendre qu’un traitement se développe. En ce moment, vous lisez probablement cet article depuis un ordinateur, qui n’utilise pas pleinement toutes ses ressources. Peut-être que le meilleur moyen d’aider à lutter contre le COVID-19 serait d’utiliser votre ordinateur pour déterminer le fonctionnement des protéines du virus afin qu’un traitement efficace puisse être développé. Si cela vous intéresse, un projet ancien mais brillant nommé Folding @ home a besoin de votre aide!

Pliant? Quelle?

Folding @ home tire son nom du processus de repliement des protéines dans les cellules organiques. Cependant, lorsqu’ils se replient de manière incorrecte, cela peut créer des problèmes qui pourraient nuire à la vie humaine. Dans la plupart des cas, comprendre les agents biologiques qui causent les maladies que nous redoutons tous implique d’étudier leurs processus de repliement des protéines pour développer des traitements qui ciblent les cellules que nous voulons éliminer sans nuire au reste de l’organisme que nous essayons de guérir.

Depuis 19 ans, Folding @ home a aidé à la recherche médicale en utilisant les ordinateurs des individus ordinaires et des organisations partenaires pour aider à simuler les processus protéiques. Cela se fait en divisant l’ensemble de la charge de travail de la simulation en paquets de la taille d’une bouchée et en envoyant chaque paquet à un ordinateur connecté au réseau pour traiter. En faisant cela, des milliers, voire des centaines de milliers d’ordinateurs peuvent travailler en harmonie pour aider à résoudre un problème spécifique.

D’où vient le COVID-19?

Folding @ home est actuellement engagé dans un projet spécial d’aide à la recherche sur le COVID-19, comme cela est visible sur leur site web. En ce moment, les développeurs en charge du projet font appel à des personnes disposant d’une puissance de calcul supplémentaire pour les aider dans leurs efforts de recherche et simuler le fonctionnement des protéines du virus.

Étant donné que de nombreux bénévoles se sont déjà mobilisés pour donner leur puissance de calcul, vous pouvez rencontrer un certain temps d’inactivité avant qu’une unité de travail ne soit affectée à votre ordinateur.

Comment fonctionne Folding @ home?

Si vous souhaitez participer aux efforts de recherche de Folding @ home, il vous suffit de télécharger leur application et installez-le. Après l’installation, cliquez sur l’icône Folding @ home dans votre barre des tâches, puis sur «Contrôle Web». Cela ouvrira une fenêtre de navigateur qui offre un contrôle simple sur votre application. Vous pouvez définir un nom pour vous identifier et suivre vos progrès.

Simulation de pliage

Par défaut, votre client utilisera probablement votre CPU. Si vous possédez un GPU puissant et que vous souhaitez faire don de ses ressources, vous devrez accéder aux paramètres de contrôle avancés. Pour ce faire, cliquez sur « Contrôle avancé » dans le même menu mentionné précédemment et cliquez sur « Configurer ».

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Dans l’onglet «slots», modifiez le slot occupé par votre CPU et remplacez-le par GPU. Dans la plupart des ordinateurs, la valeur « gpu-index » peut être laissée à « -1 ». Si vous rencontrez des difficultés pour que le client reconnaisse votre GPU, essayez d’utiliser «0» comme valeur pour «gpu-index». Cela place automatiquement votre premier GPU comme celui qui traite les unités de travail. Vous pouvez toujours configurer un autre GPU pour cela si vous en avez plusieurs sur votre système.

Des applications comme celles-ci consommeront une quantité importante des ressources de votre ordinateur, vous ne devriez donc traiter les unités de travail que lorsque vous n’utilisez pas votre ordinateur pour d’autres travaux intenses (tels que l’édition graphique ou les jeux). Vous pouvez toujours suspendre le projet de pliage et le continuer plus tard et même faire arrêter le pliage de votre ordinateur dès qu’il est terminé avec les unités actuellement attribuées.

Cela aide-t-il réellement l’effort?

Utiliser un tas d’ordinateurs pour traiter des unités de travail qui peuvent ou non révéler des informations utilisables sur le fonctionnement des protéines virales peut sembler quelque chose de peu spectaculaire, mais cela a historiquement aidé les professionnels à déterminer les voies de traitement des maladies.

Le 10 février 2020, certains chercheurs utilisant le projet Folding @ home publié un article révélant que la protéine VP35 essentielle du virus Ebola a une petite voie cachée qui pourrait recevoir un traitement. Cela a permis de faire un petit mais important saut dans la compréhension de la maladie, ce qui a amélioré la capacité de la combattre.

Toutes ces simulations aident à découvrir des poches microscopiques cachées dans des maladies qui peuvent s’avérer essentielles pour éliminer une maladie. Cela ne change pas pour COVID-19. Aussi petite que soit votre puissance de calcul, elle joue un rôle dans un projet plus vaste qui aidera éventuellement les professionnels de la santé à comprendre comment lutter contre cette maladie.

Maintenant que nous disposons de la technologie pour nous aider à comprendre le monde dans lequel nous vivons, de la dimension microscopique des virus aux vastes étendues de l’univers, nos petites contributions aux efforts de recherche nous aideront à éclairer les voies vers des solutions que nous avons déjà eu du mal à réaliser.

Si vous avez des questions concernant la mise en service de Folding @ home, n’hésitez pas à laisser un commentaire et vous trouverez de l’aide en cours de route!

Moyens Staff
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